Lutter contre la résistance aux antibiotiques avec BacTail

Exploitons la puissance des bactériophages combinée à des bactéries afin de lutter contre la résistance aux antibiotiques.

Visuel du projet Lutter contre la résistance aux antibiotiques avec BacTail
Réussi
91
Contributions
18/06/2020
Date de fin
5 036 €
Sur 5 000 €
101 %
Santé
et Handicap
Éducation

Lutter contre la résistance aux antibiotiques avec BacTail

<p>Savez-vous que d&rsquo;ici 2050, d&#39;apr&egrave;s l&#39;OMS, 10 millions de personnes mourront chaque ann&eacute;e &agrave; cause de la r&eacute;sistance aux antibiotiques ? De plus, aucune nouvelle famille d&#39;antibiotique n&#39;a &eacute;t&eacute; mise sur le march&eacute;&nbsp;depuis plus de 25 ans.&nbsp;Et parce que &ldquo;les antibiotiques c&rsquo;est pas automatique&rdquo;,&nbsp;repoussons les limites de&nbsp;la biologie synth&eacute;tique !&nbsp;</p> <p>Le projet BacTail propose alorsd&rsquo;apporter une solution alternative &agrave; l&rsquo;usage des antibiotiques via la biologie de synth&egrave;se pour lutter contre certaines bact&eacute;ries pathog&egrave;nes et notamment celles r&eacute;sistantes aux antibiotiques. La&nbsp;biologie de synth&egrave;se se d&eacute;finie comme l&rsquo;ing&eacute;nierie du vivant, il ne s&rsquo;agit plus seulement de comprendre le vivant mais de concevoir en le &laquo; redesignant &raquo; gr&acirc;ce &agrave; l&rsquo;association de la biologie et de l&rsquo;informatique.</p> <p>Pour r&eacute;pondre &agrave; notre probl&eacute;matique, nous proposons de modifier g&eacute;n&eacute;tiquement des bact&eacute;ries afin de leur int&eacute;grer l&rsquo;&eacute;l&eacute;ment des bact&eacute;riophages qui leur conf&egrave;re cette reconnaissance ultra sp&eacute;cifique d&rsquo;une bact&eacute;rie cible.&nbsp;</p> <p>Dans le cadre de la comp&eacute;tition internationale iGEM, nous aurons l&rsquo;opportunit&eacute; de nous confronter &agrave; plus de 300 &eacute;quipes du monde entier et d&rsquo;&ecirc;tre jug&eacute;s par un comit&eacute; de scientifiques.</p> <p>Pour mener &agrave; bien le projet, nous avons besoin de financer notre preuve de concept ainsi que notre participation &agrave; l&rsquo;International Genetically Engineered Machine (IGEM), une comp&eacute;tition internationale &eacute;tudiante dans le domaine de la biologie de synth&egrave;se.</p> <p>&nbsp;</p> <p><strong>QUI SOMMES NOUS ?</strong></p> <p>Le IONIS Education Group est le premier groupe de l&rsquo;enseignement priv&eacute; en France. Il rassemble plus de 25 &eacute;coles et entit&eacute;s dans 18 villes de France et &agrave; l&rsquo;international soit plus de 28 500 &eacute;tudiants en biotechnologie, marketing, gestion et finance, informatique et num&eacute;rique, &eacute;nergie, transport ou encore cr&eacute;ation. Le Groupe IONIS s&rsquo;est donn&eacute; pour vocation de former la nouvelle intelligence des entreprises d&rsquo;aujourd&rsquo;hui et de demain.&nbsp;L&rsquo;iGEM IONIS est une association cr&eacute;&eacute;e &agrave; l&rsquo;initiative d&rsquo;&eacute;tudiants du Groupe IONIS.&nbsp;L&rsquo;association a &eacute;t&eacute; fond&eacute;e en 2015 avec pour objectif de proposer aux &eacute;tudiants de Sup&rsquo;Biotech de participer &agrave; la comp&eacute;tition internationale qu&rsquo;est l&rsquo;iGEM. Depuis la premi&egrave;re participation, les &eacute;quipes IGEM IONIS 2015, 2016 et 2017 ont remport&eacute; chacune une m&eacute;daille d&rsquo;or et de nombreuses nominations.</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/662024/iGEM_IONIS-1588174513.png" width="100%" /></p> <p>Cette ann&eacute;e l&rsquo;&eacute;quipe iGEM IONIS 2020 se lance dans l&rsquo;aventure et esp&egrave;re &ecirc;tre &agrave; la hauteur des &eacute;quipes pr&eacute;c&eacute;dentes. Notre &eacute;quipe se compose de 10&nbsp;&eacute;tudiants issus des &eacute;coles d&rsquo;ing&eacute;nieur du groupes IONIS : 6 &eacute;tudiants de Sup&rsquo;Biotech (Biotechnologies) et 4&nbsp;&eacute;tudiants de l&rsquo;ESME Sudria (Robotique, Electronique, Informatique). Ces diff&eacute;rents profils nous permettent d&rsquo;avoir une &eacute;quipe pluridisciplinaire.</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/667245/Capture_d__cran_2020-05-31___15.26.35-1590931635.png" width="100%" /></p> <p><strong>NOTRE PROJET</strong></p> <p>Selon l&rsquo;OMS, d&rsquo;ici 2050, 10 millions de personnes mourront chaque ann&eacute;e &agrave; cause de la r&eacute;sistance aux antibiotiques. De plus, aucune nouvelle famille d&rsquo;antibiotique n&rsquo;a &eacute;t&eacute; mise sur le march&eacute; depuis plus de 25 ans.</p> <p>Un antibiotique, est une substance naturelle ou synth&eacute;tique qui d&eacute;truit ou bloque la croissance des bact&eacute;ries. Dans le premier cas, on parle d&rsquo;antibiotique bact&eacute;ricide et dans le second cas d&rsquo;antibiotique bact&eacute;riostatique. Les antibiotiques ont &eacute;t&eacute; introduits dans le quotidien des Hommes au lendemain de la Seconde Guerre Mondiale. L&rsquo;antibiotique est consid&eacute;r&eacute; comme l&rsquo;un des progr&egrave;s th&eacute;rapeutiques les plus importants du XX&egrave;me si&egrave;cle. En effet, il a fait cro&icirc;tre l&rsquo;esp&eacute;rance de vie de plus de dix ans. Cependant, l&rsquo;usage g&eacute;n&eacute;ralis&eacute;, voire abusif de certains antibiotiques a conduit au d&eacute;veloppement de bact&eacute;ries antibio-r&eacute;sistantes, et ainsi &agrave; une diminution de l&rsquo;efficacit&eacute; th&eacute;rapeutique des antibiotiques. En milieu hospitalier par exemple, cette r&eacute;sistance aboutit &agrave; une augmentation des maladies nosocomiales &agrave; d&eacute;faut de m&eacute;dication adapt&eacute; &agrave; certains germes particuli&egrave;rement r&eacute;sistants tels qu&rsquo;<em>Escherichia coli.&nbsp;</em>D&rsquo;apr&egrave;s le Minist&egrave;re de la Sant&eacute;, il est estim&eacute; que les maladies nosocomiales sont les causes de 4&nbsp;000 d&eacute;c&egrave;s par an en France.</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/662028/noso-1588174664.jpg" width="100%" /></p> <p>Et parce que &laquo;&nbsp;les antibiotiques c&rsquo;est pas automatique&nbsp;&raquo;, nous souhaitons repousser les limites de la biologie synth&eacute;tique afin de contourner cette r&eacute;sistance&nbsp;!</p> <p>L&rsquo;&eacute;quipe iGEM IONIS 2020 propose alors d&rsquo;apporter une solution alternative &agrave; l&rsquo;usage des antibiotiques via la biologie de synth&egrave;se pour lutter contre certaines bact&eacute;ries pathog&egrave;nes et notamment celles r&eacute;sistantes aux antibiotiques. La biologie de synth&egrave;se se d&eacute;finie comme l&rsquo;ing&eacute;nierie du vivant, il ne s&rsquo;agit plus seulement de comprendre le vivant mais de concevoir en le &laquo; redesignant &raquo; gr&acirc;ce &agrave; l&rsquo;association de la biologie et de l&rsquo;informatique.</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/662405/Capture_d__cran_2020-04-29___17.33.23-1588266745.png" width="100%" /></p> <p>Pour r&eacute;pondre &agrave; cette probl&eacute;matique de sant&eacute; majeure, nous avons pens&eacute; le projet BacTail qui vise &agrave; utiliser certains g&egrave;nes provenant de bact&eacute;riophages leurs conf&eacute;rant une propri&eacute;t&eacute; de reconnaissance et de lyse bact&eacute;rienne&nbsp;; les LTF (Long Tail Fiber). Un bact&eacute;riophage est un virus n&rsquo;infectant que les bact&eacute;ries. Ces derniers sont compos&eacute;s d&rsquo;une capside renfermant leur g&eacute;nome, d&rsquo;une gaine ainsi que des fibres caudales autrement appel&eacute;es LTF.</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/662033/Structure_d_un_bact_riophage-1588174801.png" width="100%" />Les &eacute;tudiants de Sup&rsquo;Biotech de iGEM IONIS vont se charger de faire exprimer ces LTF provenant de bact&eacute;riophages de la famille des&nbsp;<em>Myoviridae&nbsp;</em>par la bact&eacute;rie <em>Escherichia coli&nbsp;</em>pour qu&rsquo;elle puisse reconna&icirc;tre, attaquer et tuer sp&eacute;cifiquement les bact&eacute;ries pathog&egrave;nes ainsi que celles ayant acquis une r&eacute;sistance aux antibiotiques.&nbsp;</p> <p>Notre preuve de concept sera bas&eacute;e sur la reconnaissance sp&eacute;cifique de notre cible, une souche non pathog&egrave;ne de&nbsp;<em>E.coli</em>&nbsp;(mimant notre bact&eacute;rie r&eacute;sistante) par <em>E.coli</em> K12 JW2203, notre bact&eacute;rie modifi&eacute;e.&nbsp;Cette reconnaissance aura pour but de d&eacute;clencher la mort de la cible&nbsp;qui repr&eacute;senterait notre bact&eacute;rie r&eacute;sistante et pathog&egrave;ne.</p> <p>Nous avons d&eacute;cid&eacute; de d&eacute;composer le projet BacTail en 3 &eacute;tapes&nbsp;:</p> <ol> <li>La reconnaissance sp&eacute;cifique de la bact&eacute;rie cible par les LTF</li> <li>Le d&eacute;clenchement de l&rsquo;attaque de la bact&eacute;rie cible</li> <li>La mort programm&eacute;e de la bact&eacute;rie modifi&eacute;e quand le travail sera fait, afin d&rsquo;&eacute;viter sa propagation dans l&#39;environnement&nbsp;</li> </ol> <p>Notre &eacute;quipe &eacute;tant &eacute;galement compos&eacute;e de 4&nbsp;&eacute;tudiants de l&rsquo;ESME Sudria sp&eacute;cialis&eacute;s en informatique et en &eacute;lectronique, nous souhaitons &eacute;galement cr&eacute;er un software,&nbsp;qui, &agrave; partir d&rsquo;une bact&eacute;rie pathog&egrave;ne cible, pourra designer le plasmide cl&eacute; &agrave; int&eacute;grer dans notre mod&egrave;le d&rsquo;&eacute;tude afin qu&rsquo;elle puisse sp&eacute;cifiquement &eacute;liminer sa cible.</p> <p>&nbsp;</p> <p><strong>QU&rsquo;EST CE QUE L&rsquo;IGEM ?</strong></p> <p>L&rsquo;International Genetically Engineered Machine, ou iGEM, est une comp&eacute;tition internationale &eacute;tudiante dans le domaine de la biologie de synth&egrave;se. Organis&eacute; par le Massachusetts Institute of Technology (MIT), le concours regroupe des &eacute;tudiants du monde entier et leur offre l&rsquo;opportunit&eacute; de repousser les limites de la biologie de synth&egrave;se en apportant des solutions aux probl&eacute;matiques actuelles dans divers domaines (Sant&eacute;, Environnement, Agroalimentaire, &Eacute;nergie, Mat&eacute;riaux, etc.).</p> <p><img alt="" src="https://d3v4jsc54141g1.cloudfront.net/uploads/project_image/image/662407/Capture_d__cran_2020-04-30___19.15.42-1588266893.png" width="100%" /></p> <p>Chaque ann&eacute;e, la comp&eacute;tition r&eacute;unit plus de 300 &eacute;quipes venues des quatre coins du monde. Les &eacute;quipes participantes sont pluridisciplinaires et se composent d&rsquo;&eacute;tudiants issus d&rsquo;universit&eacute;s, d&rsquo;&eacute;coles d&rsquo;ing&eacute;nieur, marketing, communication ou encore de design. A la fin du concours, toutes les &eacute;quipes pr&eacute;sentent leur projet aux diff&eacute;rents jurys lors du Giant Jamboree.&nbsp;</p> <p>Au sein de notre cursus, nous avons l&rsquo;opportunit&eacute; de mener &agrave; bien l&rsquo;aventure internationale IGEM. L&rsquo;importance de ce projet r&eacute;side dans sa pluridisciplinarit&eacute; et l&rsquo;occasion pour nous de vivre une exp&eacute;rience unique et d&eacute;velopper des comp&eacute;tences indispensables &agrave; notre future carri&egrave;re professionnelle dans le cadre d&rsquo;un cursus d&rsquo;ing&eacute;nieur. De plus, nos donn&eacute;es et r&eacute;sultats sont consid&eacute;r&eacute;s open-source : ils peuvent donc &ecirc;tre r&eacute;utilis&eacute;s par d&rsquo;autres entreprises, laboratoires, ou futures &eacute;quipes iGEM, pour leurs projets ou pour faire avancer la recherche. L&rsquo;ensemble des comp&eacute;tences &agrave; acqu&eacute;rir nous permet ainsi d&rsquo;&ecirc;tre autonomes, organis&eacute;s, et d&rsquo;amorcer notre insertion professionnelle future. Enfin, nous apprenons &agrave; &eacute;tablir notre r&eacute;seau professionnel dans un contexte international.</p>

À quoi servira la collecte

<p>Afin de pr&eacute;senter notre projet au concours iGEM, nous devons &eacute;tablir notre preuve de concept et donc r&eacute;aliser nos exp&eacute;riences en laboratoire. Pour cela, nous avons besoin d&rsquo;acheter du mat&eacute;riel de laboratoire ainsi que des consommables. Nous &eacute;valuons ces frais &agrave; hauteur de 10&nbsp;000&euro;. Cette &eacute;tape est cruciale au bon d&eacute;roulement de notre projet. C&rsquo;est pourquoi nous faisons appel &agrave; vous.</p> <p>Pour cela, nous nous sommes fix&eacute;s 3 paliers:</p> <p>-Palier 1: &nbsp;5 000&euro; - Gr&acirc;ce &agrave; vous, nous sommes en mesure de financer 50% des consommables n&eacute;cessaires au laboratoire.</p> <p>-Palier 2: &nbsp;10 000&euro; - Gr&acirc;ce &agrave; votre g&eacute;n&eacute;rosit&eacute;, nous pouvons financer 100% des consommables.</p> <p>-Palier 3: &nbsp;15 000&euro; - Gr&acirc;ce &agrave; vos donations, nous pouvons financer 100% des consommables AINSI QUE notre participation &agrave; la grande finale du concours iGEM!</p> <p>Si vous souhaitez nous soutenir dans cette incroyable aventure et contribuer &agrave; la premi&egrave;re &eacute;tape qu&rsquo;est l&rsquo;inscription, n&rsquo;attendez plus.</p> <p>&nbsp;</p> <p>&nbsp;</p> <p><strong>REMERCIEMENTS</strong></p> <p>Un grand merci &agrave; toutes les personnes qui ont pris le temps de lire l&rsquo;int&eacute;gralit&eacute; de notre projet.</p> <p>Merci &agrave; tous ceux qui vont participer &agrave; cette campagne de financement, que ce soit aussi bien avec de petites comme de plus grandes donations. Nous tenons &eacute;galement &agrave; remercier toutes les personnes qui nous soutiennent et croient en ce projet.</p>

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